—吏部
- 尚書：正二品。為吏部之首，總攬吏部事務，如官員銓選（包括科舉中式後的初次授官、官員的升遷、平調等）、考課（定期對官員政績進行考核評估）、封授（爵位、勳位、散官等的授予）等諸多事務。例如，決定地方知縣、中央各部主事等各級官員的人選安排。
- 左右侍郎：正三品。左侍郎偏重文選（文官的選拔任用等事務），右侍郎側重考功（考核官員的功績等）。他們輔助尚書，參與官員任免決策，在尚書不能履職時可代行其職。如在大規模官員考核時期，協助尚書組織考課事宜。
- 郎中：正五品。吏部下設文選司、考功司、驗封司、稽勳司四個司。文選司郎中主管文官的銓選，考功司郎中負責考核官員的功過，驗封司郎中處理官員的封爵、世蔭等事務，稽勳司郎中掌管官員的勳級、名籍等事務。以文選司郎中為例，要詳細審查官員的出身、資歷、才能等資訊來確定其任職資格。
- 主事：正六品。各司主事具體辦事，如在文選司，主事可能負責整理官員履歷檔案、核對科舉成績等細節工作；考功司主事則負責記錄官員日常政績、過錯等具體事項，為考課提供原始材料。
—戶部
- 尚書：正二品。掌管全國土地、戶籍、賦稅、財政收支等事務。包括田賦的徵收標準制定、各地戶口的統計核查、國家財政預算與決算等大事。例如，根據不同地區的土地肥沃程度和農作物產量來調整田賦額度。
- 左右侍郎：正三品。協助尚書管理戶部事務，如左侍郎負責北方地區的錢糧事務，右侍郎負責南方地區的錢糧事務（這只是一種可能的分工）。在組織大規模賦稅徵收時，他們監督各地賦稅上繳情況。
- 郎中：正五品。戶部按地域分為十三司，每個司的郎中主管相應地區的財政事務。如浙江司郎中負責浙江地區的田賦、鹽課、關稅等財政收入的核算和管理，還要處理該地區的財政支出事務，如官俸、軍費等。
- 主事：正六品。各司主事協助郎中工作。在田賦徵收季節，主事可能深入基層，核實土地面積和產量，監督賦稅的登記和上繳流程；在財政支出方面，負責核對各項開支的賬目和票據等。
—禮部
- 尚書：正二品。主管國家典禮、祭祀、科舉、學校、外交等事務。像皇帝登基、大婚、郊祀等重大典禮都由禮部尚書統籌安排。在科舉方面，確定考試科目、時間、規則等。
- 左右侍郎：正三品。左侍郎可能側重於禮儀制度的制定和執行，如修訂祭祀禮儀規範；右侍郎則可能重點在科舉事務和教育機構管理上。在舉辦大型祭祀活動時，他們協助尚書調配人員、物資。
- 郎中：正五品。禮部下設儀制司、祠祭司、主客司、精膳司四個司。儀制司郎中負責制定各種禮儀制度和儀式流程，祠祭司郎中主管祭祀儀式的具體安排和神只祭祀事務，主客司郎中處理外國使節接待和朝貢事務，精膳司郎中負責宴會等餐飲禮儀事務。
- 主事：正六品。各司主事具體落實事務。如儀制司主事負責記錄禮儀執行情況，祠祭司主事準備祭祀用品清單並監督採購，主客司主事安排外國使節的起居行程，精膳司主事籌備宴會菜品和餐具等細節。
—兵部
- 尚書：正二品。掌管全國軍政事務，包括武官選授、軍隊訓練、兵器製造管理、馬政等，但軍令權主要在五軍都督府。例如，負責選拔衛所武官，組織軍隊春、秋兩季的訓練等事務。
- 左右侍郎：正三品。左侍郎可能側重武官人事管理，如考核武官的武藝、品德等；右侍郎可能更關注軍事後勤和裝備，如兵器的製造質量、軍隊糧草供應等。在戰爭時期，協助尚書調配軍事資源。
- 郎中：正五品。兵部設有武選司、職方司、車駕司、武庫司四個司。武選司郎中主管武官的選拔任用，職方司郎中負責軍事地圖繪製、邊防要塞的規劃和管理，車駕司郎中管理驛站、郵傳和宮廷車馬，武庫司郎中負責兵器的儲備和發放。
- 主事：正六品。各司主事具體辦事。武選司主事可能負責武官選拔考試的具體組織，職方司主事更新和保管軍事地圖資料，車駕司主事安排驛站的人員和物資，武庫司主事盤點兵器庫存等。
—刑部
- 尚書：正二品。負責全國刑名司法事務，包括案件審判、法律制定與解釋、監獄管理等。如複核地方重大刑事案件，對法律條文進行解釋以指導司法實踐。