1580）秋，潘季馴向朝廷立下的3年治河不見成效甘受軍法論罪的軍令狀期滿，成就卓然，不可磨滅，當年彈劾他的朝廷大員無話可說，萬曆皇帝更是滿意潘季馴的治河功績，誇讚有加，著升他為兵部尚書，後改任刑部尚書。
不要期望潘季馴從此可以一帆風順。
高度集權、高度專制的封建王朝歷來波譎雲詭，充滿風浪，充滿玄機。萬曆十二年（1584），曾經威震朝野、叱吒風雲的宰相張居去世。就是這位為穩固帝國做出過巨大貢獻的宰相，死後獲得個其家被抄的悲慘命運。一則是有恩於己，更在於品質使然，剛正不阿的潘季馴挺身而出，替張居正80多歲的老母求情免罪。
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三落四起戰黃河（6）
你潘季馴不跳出來都有人想治你的罪，何況你自投羅網？！隨即，他再遭人彈劾，以“黨庇居正”之罪落職為民。
就這樣，熱愛治水，心繫黃、淮、運，心繫百姓安危的潘季馴，懷揣上次被貶時寫成的《河防一覽》，石壓歸航，淒涼離職。
一個不重視制度建設的朝廷，最容易因人興事，因人廢事。潘季馴離去後，朝廷河務鬆懈，河工廢弛，連管理河道的官職也不再設立了。幾年之後，河患又多次發生。朝廷責令安撫使臣和地方官吏分割槽治理，然而，巨大的人力物力全都扔進黃河打了水漂，黃患依然。黃患日甚一日。
在無濟於事的嚴峻關頭，朝廷再一次想起了落職為民的潘季馴。
萬曆十六年（1588），神宗皇帝再次降旨，第四次起用已是67歲高齡的潘季馴，任命他為總理河漕。
走上萬歷六年（1578）自己向朝廷立下軍令狀築成的運河大堤，潘季馴淚粘衣襟：治河有定義而河防無止工，治河沒有一勞永逸的事。可以，自己離去不過4年，上次所修的堤防卻因車馬之蹂躪，風雨之剝蝕，大部分已高者日卑，厚者日薄，破敗不堪！這怎不叫他悲傷？這怎不叫他落淚？
遭受屢用屢貶命運的潘季馴，矢志不改，一旦走上崗位，奮發如初： “民以食為天，水者食之原也。然所以為利，亦所以為害，在善導之而已。”（項忠：《新開廣惠渠記》）“渠道之修，所以興夫水府之利，以足夫民食也。自古為治，率不免用心於此焉。”（出處同上）
一到任，沒有進衙門喝口水，背囊在肩，他立馬走上運河大堤。只有在大堤上，只有看到暢流的運河，潘季馴才感到自己生命的活力，才感到自身的價值。
他徵來數萬民工，在南直隸、河南、山東等地，對舊有的27萬多丈堤防閘壩普遍進行整修加固，又在黃河兩岸大築遙堤、縷堤、月堤和格堤，共長萬丈，督修新堰閘24座，土石月堤護堤51處，堵塞決口和疏浚淤河30餘萬丈。他“日與役夫雜處畚鍤葦蕭間，沐風雨，裹霜露”，那股幹勁，那份精神，怎麼看也不像是位已經年逾花甲的老人，倒像是位從來沒有遭受過挫折的新官。
由於潘季馴大力整治，使明王朝生命線的京杭大運河暢通無阻。神宗皇帝因此晉升潘季馴為太子太保、工部尚書兼右都御史。
是潘季馴成就了運河，還是運河成就了潘季馴？我相信，潘季馴就是運河的兒子；我相信，正因為潘季馴真正心繫運河，運河也就格外地垂青潘季馴。
萬曆二十年（1592），71歲高齡的潘季馴，因年逾古稀，且積勞成疾，乞休離職。神宗皇帝準請。
那日，潘季馴最後一次上朝，向神宗皇帝辭行。說起一生治水半在運河，潘季馴潸然淚下，當著皇帝的面竟泣不成聲。
神宗皇帝執老臣之手，神色闇然：功高昭日的潘季馴起起落落，不大多在自個的任上嗎？身為皇帝，朕這是怎麼了？為什麼要讓如此善良又如此卓越的帝國人才非要遭受這般的磨難呢？真的是不可避免的嗎？
神宗皇帝陷入了自責之中，以至潘季馴抽出被握著的手，起身辭行，他一點都沒有絕出。
就在快要走出奉天殿時，潘季馴再次回過頭來，向端坐在龍椅上發楞的神宗皇帝，向大明朝廷說出了最後的心聲，那聲音蒼茫至極，在大殿裡悠悠迴盪，繞樑不絕——
去國之臣，心憂在河！
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決勝清口（1）
明天啟七年（1627），陝西澄城知縣張鬥耀，催逼糧食。賦役苛重、官吏暴貪、民不聊生，農民無糧可交。交不上就打。農民憤怒了！澄城白水王二怒殺坐堂拷打農民的知縣張鬥耀，揭開了明末農民大起義