。當時，受株連被捕獲的有六七百人關在監獄中，家產被沒收的有五千人。司刑使一個勁地逼促行刑。狄仁傑認為李貞及骨幹分子都已經戰敗死亡，而這些人不過是被脅迫無奈參與的，於是冒著危險，上疏武則天，給這些人請命，表章中提到，他反覆幾次寫了後撕毀，撕毀又寫，非常矛盾。這說明他也是經過了激烈的思想鬥爭。因為這個事件本身很敏感，這個時期也正是白色恐怖盛行的時候。狄仁傑這麼做，實際上是冒了很大危險的。他完全可以按部就班地執行命令。可他終於還是勇敢上書了。所謂“仁者必有勇”，狄仁傑就是一個很好的例子。武則天聽從了他的建議，特赦了這批死囚，改為流放。
這個結果，可以再次證明，武則天實際上是很關注狄仁傑的。事實上，幾乎每次狄仁傑的奏章，都被許可。這應該可以視為武則天對狄仁傑的大力支援和配合。
這六七百人最後被朝廷發配到豐州（今內蒙古五原一帶）充軍。當這些九死一生的流徒路過寧州時，寧州父老告訴他們：“是我狄使君救了你們的命呀！”於是雙方一起到早先州民所立的“狄公德政碑”下痛哭。押解差役和寧州官吏也十分感動，允許寧州父老的請求，“設齋三日”，招待流徒。因此，後世將“狄公德政碑”又稱為“梁公墜淚碑”，並在立碑處建“狄梁公廟”。後來，宋代的范仲淹在這裡做官時，曾專門寫了狄梁公的碑文，以記述狄仁傑的事蹟。而多少年風吹雨打過去後，狄梁公廟至今還在。
流人被送走了，但前來平定叛亂的將士們卻不容易被打發。將士們倚仗著有功，橫行霸道，大肆勒索。此時率軍的是宰相張光輔，他不加制止，反而予以縱容。豫州剛剛經歷戰爭，府庫空虛。狄仁傑沒有理會，張光輔大怒，小小刺史竟敢藐視自己這個宰相兼元帥？狄仁傑針鋒相對，毫不退讓，說：“亂河南者，一越王貞耳。今一貞死而萬貞生。”意思是河南叛亂的不過是一個李貞罷了，而你縱容將士勒索，與李貞一樣。還怒斥張光輔殺戮降卒，以邀戰功，甚至說出“如我有尚方寶劍，我就一劍砍了你，我雖死如歸”這樣激憤的話語。要知道張光輔身居宰相，位高權重，眼下又手握重兵，新立大功，而且也心狠手辣，實在是個不可得罪的人物。可狄仁傑深深痛恨張光輔亂殺平民，以冒軍功，顯示忠誠（拿平民的頭冒充敵人首級，在古代一些混蛋將領手裡是常見現象）的可恥行為。狄仁傑性格剛烈，不畏權貴，這一番話，真是痛快淋漓，擲地有聲。在他的凜然正氣面前，張光輔居然也就偃旗息鼓，無言以對。
不過他懷恨在心，還朝後奏狄仁傑出言不遜。武則天暫時將狄仁傑貶到復州（今湖北沔陽西南）。可笑的是，一年之後，張光輔以不忠的罪名被處死，而狄仁傑則被調任洛州司馬，其實是調回中央（因為武則天是以東京洛陽為她的統治中心的）。
但這次回去，狄仁傑遇到了一次生死劫難。
八、鬥智鬥勇
天授元年（690），武則天改朝換代，正式稱帝。
天授二年（691）九月，狄仁傑被任命為地官（戶部）侍郎、同鳳閣鸞臺平章事，開始了他的第一次宰相生涯。兩人經歷，再次契合。
武則天起用狄仁傑，實在是因為朝中無人。就在天授元年、二年的這兩年，被殺的宰相有七個，還有一個被流放。雖然還有武承嗣、武攸寧等做宰相，不過他們都是政治可靠，能力平庸。狄仁傑是拉來幹活的。
但是這一時期氣氛非常緊張，酷吏政治正是高潮階段，最突出的特點就是羅織罪名，株連成風，成片打擊。以來俊臣為首的一批酷吏無惡不作、不擇手段、膽大包天、兇殘無比。他們要打擊誰，幾乎沒有邏輯可言，因為他們只要殺人，就是立功。殺的越是高官，功勞就越大。所以，身為宰相卻又剛正不阿的狄仁傑在劫難逃。
狄仁傑九月入相，來年三月，來俊臣就告發了一個大案——包括三個宰相（任知古、狄仁傑、裴行本）在內的七個高官謀反。眨眼間，這些高官統統被捕入獄。
這不是一般的監獄，叫“詔獄”，意思是為皇帝特詔辦理的案件而設定的監獄。實際上，詔獄純粹是酷吏用來折磨人的行刑場。當時號稱，“入此獄者，非死不能出”。可以說，狄仁傑遭遇到了空前的危險。
被捕之後，來俊臣誘騙他們說，只要老實坦白，可以從寬免死。但大家都知道這是鬼話，然而狄仁傑出乎意料乾乾脆脆地承認自己謀反：“大周革命，萬物唯新，唐朝舊臣，甘從誅戮。反是實！”來俊臣很高興，於是放鬆了警惕，將他關在牢裡，就等皇帝複核之後行