機的六角氏開始和淺井氏展開互相攻伐,淺井氏此後再未佔到半點便宜。
信長上洛的捷徑便是透過六角氏領地,而且義賢父子與三好、松永兩家交厚,曾發兵攻打過義昭,因此信長準備首先攻取觀音寺城。淺井氏當主正是娶了絕代美女市姬、信長的妹夫淺井長政,信長的上洛大軍聯合淺井軍進攻觀音寺城。義賢父子則以觀音寺城為中心,召集各地支城,以籠城對抗信長。對義賢早已不滿的日野江城城主蒲生賢秀等南近江諸豪紛紛倒戈,投向信長。織田、淺井聯軍勢如破竹,觀音寺城很快便被攻陷,義賢父子倉皇逃往伊賀。後來,義治投靠了武田信玄,六角氏滅亡。至此,信長控制了南近江地區。
此時,洛中地區正處於三好、松永兩家連番惡戰之中。不久,上洛大軍便乘虛殺入山城國。佔據京都的“三好三人眾”不敢抵抗織田、淺井聯軍,被迫退出洛中,西走攝津、讚岐等地。久秀也自知不是敵手,匆忙獻上名茶器“作物茄子”,降伏於聯軍。信長知道畿內勢力錯綜複雜,非短日內可以平定,便赦免了久秀弒殺將軍之罪,納其入麾下,仍領大和國。
九月廿八,久秀說服留在京都的三好義繼出降,信長威風凜凜地進入京都,麾下士兵對百姓秋毫無犯。信長將義昭安置在京都的本國寺,並於十月十八上奏朝廷,擁立義昭為新任幕府將軍。朝廷照準,義昭成為室町幕府的第十五代徵夷大將軍,同時也是室町幕府的末代將軍,明智光秀也因此在幕府供職。
義昭因感激信長而尊稱其為“御父”,並於十月廿八宴請信長觀看能劇。席間推杯換盞,義昭謂信長道:“寡人此次繼任將軍,承蒙御父鼎力相助,感激之至。如今百廢待興,寡人力不從心,望御父就任管領一職,加以輔佐。”信長笑道:“承蒙將軍厚愛,然領國公事繁忙,恐分身無術。”義昭又道:“不若請御父就任副將軍,何如?”副將軍一職從來都不存在,但無論授予何職,義昭都是想將信長納入麾下,欲藉助信長之力重振幕府。信長對此心知肚明,他的目的是奪取天下,而不是成為幕府的走卒,因此他又推掉副將軍之職,不久便返回岐阜城。
義昭上任不久便開始著手鞏固幕府勢力,分封了多個大名,但未曾請示信長,因此招致信長不滿。信長剛回岐阜城,“三好三人眾”便聯合流浪在外的齋藤龍興等人包圍了本國寺。義昭身邊只有數百近衛及信長留下的少量武士,自然不敵,節節敗退。三好義繼、池田勝正等畿內諸豪聞訊趕來支援,並擊退敵兵。信長聞訊,親率十餘騎,冒雪入京。他又重修被戰火毀壞的二條城,同時整修皇宮,朝廷對其大加讚揚。
卻說伊勢國位於尾張西面,幕府一直未在伊勢派駐守護,而是由朝廷任命的國司管理,該職一直由北畠氏擔任。早在永祿十年(1567)八月,即包圍美濃國稻葉山城的當月,信長就派瀧川一益進攻伊勢,北伊勢諸豪族長野氏、工藤氏、神戶氏、關氏等紛紛望風而降,信長將北伊勢納入囊中。
上洛成功後,信長又把矛頭指向南伊勢。居於南伊勢的北畠氏當主北畠具教乃是劍道高手,曾得“劍聖”冢原卜傳 真傳,自創了伊勢新當流,還收留了很多劍客在身邊,此外他還精通和歌,乃一代儒將。永祿十二年(1569)五月,具教之弟木造具政暗通訊長,瀧川一益乘機從北伊勢出兵。具教勇猛過人,一益不敵,大敗而回。
七月,伊賀國人 仁木長政 投向織田氏。八月,信長統軍,號稱七萬,浩浩蕩蕩向南伊勢殺來。具教率眾一萬六千人嚴陣以待,欲與織田軍決一死戰。兩軍鏖戰之際,木造具政突然率隊倒戈,具教大敗,逃回本城大河內城。八月廿八,織田軍繞過固守不降的數座敵城,直撲大河內城,並佈陣於桂瀨山。一益攻下支城阿坂城後,參加了大河內城攻城戰(記於《信長公記》)。大河內城城堅糧足,北畠氏重臣 鳥屋尾石見守 防守得法,織田軍圍城兩月,卻所獲甚少。信長借和談拖延時間,同時策反了城內的北畠氏家臣。十月廿七,具教萬般無奈之下開城投降。落城後,具教被迫讓位予其子北畠具房,出家為僧。信長又迫使具房收其次子茶筅丸為養子,還讓具教美麗的四女雪姫和茶筅丸訂婚,並立茶筅丸為下一代繼承人。信長由此完全控制了伊勢,成為統治尾張、美濃、伊勢三國的大名。
元龜二年(1571),茶筅丸於舟江城元服,改名北畠信雄,與雪姫舉行了婚禮。天正四年(1576)臘月,信雄率軍襲擊具教隱居的三瀨御所,具教討殺十九人,重傷百餘人後,跳上石垣,切腹自盡,時年四十九歲。信雄又襲擊多氣御所,隱居的具房隻身