、蔣經國到達長春後，接收一直不順利。蔣軍究竟是從海上還是從空中進入東北，蘇軍一直故意拖著不答覆。
至11月中旬後，共產黨和八路軍在長春撤換了偽滿市長曹肇元，換了中共黨員劉居英接替。後來還任命張慶和為市公安局局長，長春城裡的守備部隊也換成了八路軍擔任。當時就連長春國民黨東北行營駐地滿炭大樓周圍都貼上了“國民黨行營滾回去”的大字標語。國民黨接收官員們一個個擔心成為八路軍的俘虜。當蔣經國將這些情報向蔣介石彙報後，蔣介石只有透過國民黨政府外交部急電蘇聯政府，進行外交交涉。莫斯科繼續行使外交手腕，答覆國民黨政府外交部的是：斯大林目前不在莫斯科，要等他回來才能處理。在無可奈何之下，蔣介石下令熊式輝將東北行營撤至山海關再說。11月16日，東北行營400 餘人乘飛機離開長春暫遷山海關。至此，國民黨第一次接收東北草草收場。
蔣介石此招也算厲害，反而使斯大林大為緊張。為了蘇聯在東北的利益，斯大林最終向蔣介石作了讓步。他覆電蔣介石，請國民黨政府派代表來莫斯科會談，並透過外交途徑，重申了對國民黨政府的支援。正因為如此，蘇軍駐東北的統帥們才態度一下子轉變得那麼快。
11月中旬以後，蘇軍開始在長春和瀋陽驅逐中共機關和部隊。並撤了長春市長劉居英的市長一職，又將偽滿市長曹肇元請了回來。蘇方雖然是在“演戲”，但是嚴重地傷害了與中共東北局的感情。
30．叛亂之鳳的四起
隨著國民黨軍加緊調兵遣將，以及東北日趨緊張的鬥爭形勢，加之擴軍中指導思想有偏差，放鬆了政治質量原則的要求，因此，從10月初開始新擴建的部隊即不斷髮生譁變。
東北局、東總的往來電報反映了這一點。10月8 日，彭真等通報：在瀋陽收編之兩團偽軍，在運昌部撤出城時，於2 日譁變。
11月25日，彭真、羅榮桓、林楓等帶領東北局機關撤出瀋陽，移師到本溪。李富春、呂正操、張平化組成東北局西滿分局至撫順；陶鑄、鄧華帶領遼寧省委和軍區去法庫。由於走得太急，甚至一些該撤的單位都沒有通知到，隨著中共的撤出，瀋陽城裡的國民黨地下軍和原偽滿官員、軍人、警察乘機大肆活動，一哄而上，衝擊中共黨政機關駐地，追殺中共黨員和八路軍幹部。
暗藏的國民黨特務和地下軍造謠惑眾，四處活動；原偽滿人員和漢奸也公開倒向國民黨，只要是身穿八路軍灰棉衣的幹部便成了他們的襲擊物件。他們在大白天的大路上向中共委任的遼寧省主席張學思的汽車扔手榴彈。中共在城市活動的一些公安局長、區委書記等的生命安全都受到了極大的威脅。
彭真得知這一情況後，於11月28日向中共中央作了報告。報告指出：我們25日退出瀋陽，此間國特即有數處騷動，並有數處警察叛反我們。接著蘇軍即大舉肅清潛伏反動武裝，聞搜捕之人甚多。
由於蘇聯紅軍的著力維持，才平息了這股叛亂。
與此同時，長春鐵路沿線的大中城市也掀起了一股叛亂浪潮。被中共收編或留用的偽滿人員、土匪、舊軍人紛紛倒戈。各地新組建的部隊和保安部隊整連、整團的譁變。剛剛建立的中共省委、縣委和地方政府遭受嚴重破壞，一些幹部被叛亂分子殺害，國民黨特務反共氣焰十分囂張。11月19日，蘇軍強迫中共人員撤離長春，造成周保中、張啟龍、伍晉南等與吉林省工委幹部到處遷移，無法正常指揮下級黨政軍機關和部隊。相反，國民黨地下軍卻組織起了什麼“吉林省黨部”和“東北黨務專員辦事處”，與中共組織公開對抗並四處發展黨員，網羅日偽，收編加委土匪。在幾天內，樺甸、農安、德惠、榆樹、舒蘭等縣都出現了國民黨的縣黨部。周保中等收編的原偽滿地方武裝絕大部分叛變了。農安縣獨立團一部500 人叛變。原地方武裝九臺數百人，懷德上千人，范家屯600 人，敦化8 個大隊中的七個半（只有一個朝鮮族中隊沒出問題），以及榆樹、舒蘭、安圖、蛟河等保安隊，也都先後叛變。叛軍多達9000多人，拖走槍支在5000以上。這是中共在吉林工作的一大損失。
哈爾濱的形勢也出現逆轉。李兆麟等抗聯幹部一直在此堅持工作，同年11月16日陳雲來到哈市主持工作，接著張聞天、高崗也來到這裡坐鎮。但是蘇軍於11月17日命令中共黨政軍機關必須於23日前退出哈市。在不得已的情況下，陳雲、高崗只得撤出哈爾濱。當時，陳雲手上僅掌握1500人的老部隊和60個幹部，處境十分危險