為都元帥，郭子興的妻弟張天佑為右副元帥，朱元璋任左副元帥。論官職地位，朱元璋位居第三。一開始，朱元璋拒絕接受，說：“大丈夫寧能受制於人耶！”但是，看到小明王氣勢正盛，有他這面旗幟也可以作為依靠，就接受了任命。然而，郭天敘年紀還小，缺乏作戰經驗，而張天佑又是一個有勇無謀的人，朱元璋身經百戰，又有李善長等一批謀士，所以這支軍隊實際上就控制在副元帥朱元璋的手中。雖然這支軍隊名義上是由大宋政權統轄，而實際上，他們並不完全聽從小明王指揮。第二年，也就是至正十六年（1356年），在這支軍隊攻打集慶的時候，由於內部將領陳埜先的叛變，郭天敘和張天佑被殺。集慶路（今南京）被攻克後改名為應天府，前面說過，朱元璋在這裡建立了江南行中書省，假小明王的令命朱元璋自任平章政事，郭子興的小兒子郭天爵當了中書右丞。郭天爵認為自己才是郭子興的直接繼承人，因此對這種權力格局極為不滿。他企圖除掉朱元璋奪回權力，但最終被朱元璋處死。從此，朱元璋就完全成為了這支軍隊的主人，也成為以應天府為中心的政權的主人。
這時候的應天，還在各種勢力的包圍之中。朱元璋奪取了應天，很多人也想奪取應天。元朝政權不用說想奪回應天。應天的地位並不穩啊。
在朱元璋的東面，有一個強大的對手，這就是張士誠。張士誠在元至正十三年（1353年）在高郵建立了周政權，自稱誠王。與朱元璋攻克集慶的同時，張士誠佔領了通州（今南通）、常熟、平江（今蘇州）、湖州、松江、常州。這些地方都是魚米之鄉富庶之地。張士誠把平江改為隆平府，把政權中心遷到隆平。朱元璋羽翼未豐，對張士誠無可奈何。他寫信給張士誠要求“睦鄰守境”，“信使往來，毋惑讒言以生邊釁”，但是張士誠不予理睬。
這時候朱元璋沒有別的辦法，只能加強防守，防止敵人進攻。“高築牆”就成為朱元璋的首要策略。所以朱元璋從此就開始加強應天府的城池建設，把城牆建得高高的，牢牢的，保住這個根據地是朱元璋的當務之急。
那麼有了城牆，敵人打不進來，僅僅保住了地盤，這還不行，還必須有糧食，還必須有經濟力量予以支援。
由於連年戰亂，農業荒廢，軍費開支過大，造成了糧食短缺。糧食問題怎麼辦？軍隊不產糧，要向百姓徵收，農民種糧食，軍隊吃糧食，似乎是千古不變的道理。
至正十八年，也就是公元1358年，朱元璋打下了婺州路。從寧國經過徽州的時候，一位叫做唐仲實的儒士前來拜見。朱元璋重視儒士，見到有學問的人，有知識的人，就要向他詢問治國謀略，詢問時務。他問道，漢高祖、光武帝、唐太宗、宋太祖、元世祖，他們在平定天下的時候，“其道何由”？他們都用了什麼辦法呢？
虹←橋書←吧←。←
第30節：第七講 秀才見了兵，說的就是理（6）
唐仲實回答說：“此數君者，皆以不嗜殺人，故能定天下。”他的建議和馮國用、馮國勝兄弟以及李善長的話如出一轍。
接著他稱讚了朱元璋不妄殺人，但是隨即就對朱元璋提出了批評。他說，你現在向百姓徵收的糧食太多，使民不得休息，不能好好過日子。原話說“民未遂生息”。什麼意思啊？朱元璋的軍隊不斷擴大，地盤不斷擴大，官員隊伍不斷擴大，都要用糧食，這些糧食無不來源於百姓。隊伍大了，需要的糧食增多了，百姓的負擔重了。
朱元璋聽到這裡，不由得讚道：“此言是也。”你說得真對，我也天天發愁，這麼多糧食都取自於百姓，沒有別的辦法，但是由於“積少而費多，取給於民，甚非得已”。我的積累很少，我的開支很大，向老百姓增加徵收，是很不得已的。但是，我所徵收的都是軍需、公費所用，“未嘗以一毫奉己”，沒有一絲一毫是為了我個人的私利。“民之勞苦，恆思所以休息之，曷嘗忘也”。我也常常在憂慮那些勞苦的老百姓們，怎麼樣才能夠使他們得到休息、才能減輕他們的負擔呢？這些事我哪裡曾經忘過呢？這是我天天想的事。
朱元璋說的也是實話。因為他在經過了儒者的改造之後，已經形成了仁義愛民的理念，他坦白向百姓徵求大量的糧食，會給百姓帶來痛苦，然而這是萬不得已的事。那麼應該怎麼辦呢？他問，如果我不向百姓徵收糧食，怎麼樣解決糧餉問題？
唐仲實說，一是靠軍隊自給，一是靠發展經濟。
朱元璋聽了唐仲實的意見以後，開始考慮在自己的地盤內發展經濟。他任用了康茂才為都水營田使，